6.2. Картографирование генома |
131 |
6.3. Методы секвенирования ДНК |
135 |
6.4. Протеомика |
140 |
6.5. Структура белков и информация |
143 |
6.6. Биоинформатика в медицине |
150 |
Раздел II. Методы биоинформационного анализа |
155 |
Глава 7. Матрицы замен |
155 |
7.1. Мера сходства последовательностей |
155 |
7.2. Вес операций редактирования |
156 |
7.3. Матрицы PAM |
159 |
7.4. Матрицы BLOSUM |
164 |
7.5. Вычисление счёта выравнивания последовательностей |
168 |
Глава 8. Алгоритмы выравнивания последовательностей |
172 |
8.1. Алгоритм динамического программирования |
172 |
8.2. Алгоритм глобального выравнивания |
175 |
8.3. Алгоритм локального выравнивания |
186 |
8.4. Приближённые методы быстрого поиска в базах данных |
188 |
8.5. Значимость выравниваний |
191 |
Глава 9. Множественное выравнивание последовательностей |
196 |
9.1. Визуализация результатов выравнивания |
197 |
9.2. Методы множественного выравнивания |
199 |
9.3. Скрытые марковские модели |
206 |
Глава 10. Филогенетический анализ |
212 |
10.1. Гомология |
212 |
10.2. Филогения и фенетика |
215 |
10.3. Кладистические методы |
220 |
10.4. Инструменты филогенетического анализа |
227 |
Раздел III. Информационные принципы в биотехнологии |
229 |
Глава 11. Секвенирование биологических последовательностей и |
|
экспрессия генов |
229 |
11.1. Открытая рамка считывания |
229 |
11.2. Определение сиквенса |
232 |
398 |
|
11.3. Ярлыки экспрессируемых последовательностей |
234 |
11.4. Экспрессия генов |
237 |
11.5. Анализ белковой экспрессии |
247 |
11.6. Использование результатов секвенирования |
253 |
Глава 12. Функционирование и организация геномов |
255 |
12.1. Проблемы анализа генов |
255 |
12.2. Локализация генов в геноме |
262 |
12.3. Геномы прокариот |
264 |
12.4. Геномы эукариот |
268 |
Глава 13. Анализ геномов |
278 |
13.1. Однонуклеотидные полиморфизмы |
278 |
13.2. Состав геномов |
283 |
13.3. Горизонтальный перенос генов |
290 |
13.4. Сравнительная геномика эукариот |
293 |
Глава 14. Анализ и предсказание белков |
297 |
14.1. Проблема расшифровки белковых структур |
297 |
14.2. Предсказание вторичной структуры белка |
301 |
14.3. Предсказание трёхмерной структуры белков |
311 |
14.4. Программы предсказания белков |
326 |
14.5. Проблемы в предсказании функции белка |
330 |
Глава 15. Биоинформатика в фармации |
336 |
15.1. Медицинская геномика и фармакогеномика |
336 |
15.2. Глобальная фармацевтическая промышленность |
344 |
15.3. Открытие и разработка лекарств |
358 |
15.4. Фармакоинформатика |
367 |
15.5. Компьютерная токсикология и иммуноинформатика |
377 |
Список условных обозначений |
388 |
Список литературы |
392 |
399
Навчальне видання
ОГУРЦОВ Олександр Миколайович
ОСНОВИ БІОІНФОРМАТИКИ
Навчальний посібник з курсів «Біоінформатика та інформаційна біотехнологія»
та «Біоінформатика та фармакоінформатика»
для студентів напряму підготовки «Біотехнологія», в тому числі для іноземних студентів
Російською мовою
Відповідальний за випуск М.Ф. Клещев Роботу до видання рекомендувала М.Г. Зінченко
В авторській редакції
План 2013 р., поз. 40.
Підп. до друку 14.12.2012 р. Формат 60×84 1/16. Папір офісний. Riso-друк. Гарнітура Таймс. Ум. друк. арк. 23,3. Наклад 300 прим.
Зам. № 97. Ціна договірна
Видавець і виготовлювач Видавничий центр НТУ «ХПІ», вул. Фрунзе, 21, м. Харків-2, 61002
Свідоцтво суб’єкта видавничої справи ДК № 3657 від 24.12.2009 р.