Добавил:
chemist5734494@gmail.com Опубликованный материал нарушает ваши авторские права? Сообщите нам.
Вуз: Предмет: Файл:

учебники / Osnovy_informatsionnoi_biologii

.pdf
Скачиваний:
1
Добавлен:
07.04.2024
Размер:
2.48 Mб
Скачать

Основы информационной биологии

Текущий (модульный) контроль осуществляется в виде письменных контрольных работ. Текущая аттестация представляет собой экзамен (в соответствии с учебным планом и учебно-методической картой) в сессионный период по дисциплине.

Основными критериями, характеризующими уровень компетентности студентов при оценке результатов текущего (модульного) контроля по дисциплине ”Основы информационной биологии“, являются:

-полнота и своевременность выполнения контрольных точек;

-глубина и характер знаний учебного материала по содержанию учебной дисциплины;

-умение анализировать явления, изучаемые в их взаимосвязи и развития;

-характер ответов на поставленные вопросы (четкость, лаконичность, логичность, последовательность и т.д.);

-умение применять теоретические положения при решении практических задач;

-умение анализировать достоверность полученных результатов.

Оценка результатов текущего (модульного) контроля проводится в процентах от количества баллов, выделенных на задание, с округлением до целого числа, по следующим критериям:

0% – задание не выполнено;

40% – задание выполнено частично и содержит существенные ошибки методического или расчетного характера;

60% – задание выполнено полностью, но содержит существенные ошибки в расчетах или в методике;

80% – задание выполнено полностью и в срок, однако содержит отдельные несущественные недостатки (размерности, выводы, оформление и т.д.);

100% – задание выполнено правильно, вовремя и без замечаний.

В случае получения неудовлетворительной (ниже 4 баллов) оценки по текущему (модульному) контролю обучающийся не допускается к текущей аттестации.

4 Примерный перечень заданий управляемой самостоятельной работы

Управляемая самостоятельная работа студента по дисциплине направлена на углубленное самостоятельное теоретическое изучение тем.

Для студентов дневной формы получения высшего образования, направления специальности 1-31 01 01-01 ”Биология (научно-производственная деятельность)“ и 1-31 01 01-03 ”Биология (биотехнология)“:

Полесский государственный университет

121

Основы информационной биологии

 

Тема

Задание по управляемой

Форма контроля

 

 

самостоятельной работе

 

 

 

 

 

 

1. Введение.

Поиск биологической

Список интернет

 

 

Информация и

информации в интернете по

ресурсов по теме

 

 

информационные

заданной теме (2 часа).

 

 

 

процессы и технологии

 

 

 

 

 

 

2. Научно-

Составление обзора научной

Аннотированный

 

 

информационная

литературы по заданной теме

библиографический

 

 

деятельность в

(2 часа).

 

 

обзор по теме

 

 

биологии

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

3. Информационные

Биодиверсикология,

Написание эссе

 

 

подходы к анализу

информационные

аспекты

 

 

 

биологических

изучения структуры и динамики

 

 

 

процессов и систем

биологического

разнообразия.

 

 

 

 

(2 часа).

 

 

 

 

 

 

Вычислительная

экология,

Написание эссе

 

 

 

основные

 

направления

 

 

 

 

исследований (2 часа).

 

 

 

4 Компьютерные

Поиск полнотекстовых научных

Предоставление в

 

 

технологии работы с

публикаций и подготовка к печати

электронном виде

 

 

текстовой

средствами доступного текстового

полнотекстовых

 

 

информацией

редактора текстового документа,

научных статей и

 

 

 

представляющего из себя

электронного

 

 

 

электронный препринт

препринта

 

 

 

(технический макет)

квалификационной

 

 

 

квалификационной (курсовой)

работы

 

 

 

работы (2 часа).

 

 

 

 

5.1 Электронные

Создание и

редактирование

Выполнение

 

 

таблицы как

электронных

таблиц в Microsoft

контрольных

 

 

инструмент работы с

Office Excel (2 часа).

заданий

 

 

массивами числовой

 

 

 

 

 

 

информации

 

 

 

 

 

 

5.2 Базы данных как

Средствами реляционных

Подготовка

 

 

инструмент работы с

систем управления базами

оригинального

 

 

массивами разнотипной

данных (РСУБД MS Access / LO

проекта базы

 

 

информации

Base и др.) создать проект

данных по

 

 

 

оригинальной базы данных

биологической

 

 

 

(4 часа).

 

 

проблематике

 

 

6.1 Визуализация

Составление

ментальных карт

Проект ментальной

 

 

данных в научных

согласно заданной тематики

карты

 

 

исследованиях и

(2 часа).

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Полесский государственный университет

 

 

122

 

Основы информационной биологии

 

образовании

Задания

проектного

типа

с

Индивидуальные

 

 

 

использованием

 

редактора

студенческие

 

 

 

векторной графики (4 часа).

 

проекты

 

 

6.2 Создание и

Задания

проектного

типа

с

Индивидуальные

 

 

демонстрация

использованием

PowerPoint,

студенческие

 

 

компьютерных

Canva, Publisher (4 часа).

 

проекты

 

 

презентаций

 

 

 

 

 

 

 

 

Для студентов дневной формы получения высшего образования

 

 

специальности 1-31 01 02 ”Биохимия“:

 

 

 

 

 

 

Тема

Задание по управляемой

 

Форма контроля

 

 

самостоятельной работе

 

 

 

 

 

 

 

 

1. Введение.

Поиск биологической

 

 

Список интернет

 

 

Информация и

информации в интернете по

 

ресурсов по теме

 

 

информационные

заданной теме (2 часа).

 

 

 

 

процессы и технологии

 

 

 

 

 

 

 

 

2. Научно-

Составление обзора научной

 

Аннотированный

 

 

информационная

литературы по заданной теме

 

библиографический

 

 

деятельность в

(2 часа).

 

 

 

 

обзор по теме

 

 

биологии

 

 

 

 

 

 

 

 

3. Информационные

Биодиверсикология,

 

 

Написание эссе

 

 

подходы к анализу

информационные

аспекты

 

 

 

биологических

изучения структуры и динамики

 

 

 

процессов и систем

биологического

разнообразия.

 

 

 

 

(2 часа).

 

 

 

 

 

 

 

4 Компьютерные

Поиск полнотекстовых научных

Предоставление в

 

 

технологии работы с

публикаций и подготовка к печати

электронном виде

 

 

текстовой

средствами доступного текстового

полнотекстовых

 

 

информацией

редактора текстового документа,

научных статей и

 

 

 

представляющего из себя

 

электронного

 

 

 

электронный препринт

 

препринта

 

 

 

(технический макет)

 

 

квалификационной

 

 

 

квалификационной (курсовой)

 

работы

 

 

 

работы (2 часа).

 

 

 

 

 

 

5.1 Электронные

Создание

и

редактирование

Выполнение

 

 

таблицы как

электронных таблиц в Microsoft

контрольных

 

 

инструмент работы с

Office Excel (2 часа).

 

 

заданий

 

 

массивами числовой

 

 

 

 

 

 

 

 

информации

 

 

 

 

 

 

 

 

5.2 Базы данных как

Средствами реляционных

 

Подготовка

 

 

инструмент работы с

систем управления базами

 

оригинального

 

 

массивами разнотипной

данных (РСУБД MS Access / LO

проекта базы

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Полесский государственный университет

 

 

 

 

123

 

Основы информационной биологии

информации

Base и др.) создать проект

 

данных по

 

оригинальной базы данных

 

биологической

 

(2 часа).

 

 

 

 

проблематике

6.1 Визуализация

Составление ментальных карт

Проект ментальной

данных в научных

согласно заданной тематики

 

карты

исследованиях и

(2 часа).

 

 

 

 

 

образовании

Задания

проектного

типа

с

Индивидуальные

 

использованием

 

редактора

студенческие

 

векторной графики (4 часа).

 

проекты

6.2 Создание и

Задания

проектного

типа

с

Индивидуальные

демонстрация

использованием

PowerPoint,

студенческие

компьютерных

Canva, Publisher (4 часа).

 

проекты

презентаций

 

 

 

 

 

 

5 Примерный перечень лабораторных работ

1.Способы и основные средства поиска информации в сети. (2 часа)

2.Оn-line информационные базы данных. (2 часа)

3.On-line каталоги публичных и специальных библиотек, их возможности

ипрактическое использование. (2 часа)

4.Формирование библиографических списков, Mendeley и др. (2 часа)

5.Вычислительная экология, основные направления исследований. (2

часа)

6.Особенности текстового оформления отдельных видов научных работ.

(2 часа)

7.Работа с файлами формата PDF, конвертация текстовых файлов из формата в формат. (2 часа)

8.Электронные таблицы: Excel, Google. (2 часа)

9.Статистика и работа с пакетами анализа данных в MS Excel. (2 часа)

10.Базы данных: создание, наполнение данными и связывание таблиц. Обеспечение целостности данных. (2 часа)

11.Запросы и формы как основной инструмент управления данными и их анализа, их варианты и практическое использование. (2 часа)

12.Отчеты как инструмент вывода данных. Виды отчетов, передача данных в текстовые редакторы. (2 часа)

13.Программные средства создания диаграмм и графиков на примере MS Excel. (2 часа)

14.Редакторы ментальных карт, их практическое использование. (2 часа)

15.Редактирование векторных изображений: Adobe Illustrator (4 часа)

16.Компьютерная планиметрия и морфометрия, определение размеров и площади биологических объектов (2 часа)

Полесский государственный университет

124

Основы информационной биологии

17.Редакторы компьютерных презентаций, принципы и технология создания презентаций. (2 часа)

18.Постерное представление результатов исследований. (2 часа)

19.Перспективы развития компьютерной биологии. (2 часа)

6 Примерный перечень реферативных работ

1.Менеджеры библиографических данных и системы управления библиографической информацией, их возможности и практическое использование.

2.Биоинформационные системы, on-line информационные базы данных.

3.Современный ассортимент текстовых редакторов, их возможности.

4.Программные продукты, используемые для распознавания текстов и особенности их практического применения.

5.Этапы разработки приложения СУБД и основные принципы проектирования баз данных.

7 Примерный перечень вопросов к экзамену:

1.Предмет и задачи информационной биологии.

2.Разделы информационной биологии.

3.Информация и информационные процессы.

4.Единство информационных процессов в природе, обществе и технике.

5.Информационные технологии, аппаратные и программные средства информатизации.

6.Этапы развития информационных технологий и средств информатизации, история их использования в биологических исследованиях.

7.Классификация информационных технологий.

8.Базовые информационные технологии научных исследований и технологии в предметной области.

9.Особенности распространения программ и программных продуктов, испытательные, демонстрационные и иные их версии.

10.«Свободное» программное обеспечение.

11.Типология научно-технической информации.

12.Информационная структура научного документа: новые знания, релевантная и нерелевантная информация, помехи (искажения), информационный шум.

13.Первичная научно-техническая информация: публикации, отчетные и другие документы, не имеющие статуса публикаций.

14.Вторичная научно-техническая информация: библиография первой и второй степени.

15.Каталоги и их разновидности (алфавитные, систематические,

Полесский государственный университет

125

Основы информационной биологии

предметные и др.). Текущая и регистрационная библиография.

16.Информационные издания: сигнальная информация, реферативные журналы и их аналоги на электронных носителях.

17.Республиканская система публичных и специальных библиотек, межбиблиотечный абонемент.

18.Сетевой доступ к образовательным и научным ресурсам, On-line каталоги публичных и специальных библиотек.

19.Электронные научные библиотеки с сетевым доступом, компьютерные базы научных библиографических данных, их возможности и правила пользования.

20.Способы и основные средства поиска информации в сети.

21.Электронные каталоги, информационно-поисковые системы, поисковые машины, метапоисковые системы и системы ускоренного поиска тематической информации.

22.Специализированные системы поиска научной информации.

23.Биодиверсикология, информационные аспекты изучения структуры и динамики биологического разнообразия.

24.Информационные индексы оценки биологического разнообразия.

25.Компьютерные технологии аккумуляции и анализа структурированной информации.

26.Базы данных как инструмент работы с массивами разнотипной структурированной информации.

27.Типы структурной организации баз данных: реляционная, иерархическая, сетевая (нейронная).

28.Основные возможности современных систем управления реляционными базами данных и их использование в биологии и экологии.

29.Функции систем управления базами данных (СУБД): определение и хранение данных, обработка данных, управление данными.

30.Основные объекты баз данных и СУБД, их функциональное назначение.

31.Этапы разработки приложения СУБД и основные принципы проектирования баз данных.

32.Таблицы, экспорт данных из других приложений. Связывание таблиц. Обеспечение целостности данных.

33.Запросы как основной инструмент управления данными и их анализа, их варианты и практическое использование.

34.Динамический и статический наборы данных. Фильтрационные, параметрические и сложные запросы.

35.Формы, их виды и назначение.

36.Виды отчетов, передача данных в текстовые редакторы.

37.Макросы, их назначение.

38.Компьютерные технологии работы с графической информацией.

Полесский государственный университет

126

Основы информационной биологии

39.Редакторы растровой графики, их возможности.

40.Цифровая фотография, фотодокументирование в биологических и экологических исследованиях.

41.Редактирований растровых изображений. Типичные процедуры оптимизации фотоизображений средствами редакторов графики.

42.Компьютерная планиметрия и морфометрия, определение размеров и площади биологических объектов.

43.Расширенные возможности современных программных средств работы

срастровой графикой.

44.Редакторы векторной графики, возможности их использования в документальном оформлении результатов исследований.

45.Векторизация изображений.

46.Визуализация данных в научных исследованиях и образовании, компьютерные презентации.

47.Программные средства создания диаграмм и графиков, встроенные функции создания графиков и диаграмм стандартных программных пакетов.

48.Организационные диаграммы и ментальные карты, их применение в науке и образовании. Редакторы ментальных карт.

49.Редакторы компьютерных презентаций, принципы создания презентаций.

50.Особенности презентаций, сопровождающих научные доклады и отражающих материалы квалификационных работ.

51.Постерное представление результатов исследований, использование редакторов векторной графики для создания постеров.

52.Компьютерные технологии работы с текстовой информацией. Особенности текстового оформления отдельных видов научных работ.

53.Текстовые редакторы, основные форматы текстовых файлов, их особенности и применение.

54.Внедрение дополнительных объектов оформления (таблицы, графические изображения и пр.) в текстовый файл.

55.Редактирование больших текстовых документов.

56.Интеллектуальные информационные технологии.

57.Технологии распознавания образов: программные продукты, используемые для распознавания текста и их особенности.

58.Системы электронного перевода текстовой информации и основные возможности их использования.

Полесский государственный университет

127

Основы информационной биологии

ПРОТОКОЛ СОГЛАСОВАНИЯ УЧЕБНОЙ ПРОГРАММЫ

 

 

Предложения об

Решение, принятое

Название учебной

 

кафедрой

 

 

изменениях в

 

дисциплины, с

Название

разработавшей учебную

содержании учебной

которой требуется

кафедры

программу (с указанием

программы по

согласование

 

даты и номера

 

 

учебной дисциплине

 

 

 

протокола)

 

 

 

 

 

 

 

 

Рекомендовать

 

Биометрия

Биохимии и

 

к утверждению учебную

биоинформатики

 

программу (протокол №

 

 

 

 

 

от

)

 

 

 

 

 

 

 

 

Рекомендовать

 

Методы системной

Биохимии и

 

к утверждению учебную

биологии

биоинформатики

 

программу (протокол №

 

 

 

от

)

 

 

 

 

 

Биоинформационный

 

 

Рекомендовать

 

анализ биологических

Биохимии и

 

к утверждению учебную

и медицинских

биоинформатики

 

программу (протокол №

данных

 

 

от

)

 

 

 

 

 

Полесский государственный университет

128

Основы информационной биологии

ДОПОЛНЕНИЯ И ИЗМЕНЕНИЯ К УЧЕБНОЙ ПРОГРАММЕ на______/ _______ учебный год

№ п/п

Дополнения и изменения

Основание

 

 

 

 

 

 

Учебная программа пересмотрена и одобрена на заседании кафедры биохимии и биоинформатики (протокол № _____ от _________20__ г.)

(название кафедры)

Заведующий кафедрой

(ученая степень, ученое звание)

 

 

 

(И.О.Фамилия)

(подпись)

УТВЕРЖДАЮ Декан факультета

(ученая степень, ученое звание)

 

 

 

(И.О.Фамилия)

(подпись)

Полесский государственный университет

129